肠道病毒EV71型浙江分离株HZ08全基因组序列分析

摘要：

目的:了解浙江省流行的肠道病毒71型HZ08株的基因特征,研究肠道病毒71型的进化及变异状况.方法:设计特异性引物,RT-PCR扩增HZ08株全基因,PCR产物纯化后克隆干T载体并进行序列测定和基因进化分析.结果::HZ08株的全基因组由7 405个核苷酸组成,编码2 193个氨基酸.HZ08的5非编码区(UTR)、VP1、VP2、VP3、VP4、P2、P3、3非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与C4亚型的毒株序列较高,分别为96.2％～99.1％,92.6％～99.1％,92.7％～98.4％,88％～99.2％,93.8％～99.5％,89.4％～99.2％,91.4％～98.8％,87.8％～100％和91.1％～98.9％.HZ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90％.根据VP1基因和全基因序列进行种系统发生分析显示HZ08株与中国陆和台湾的病毒进化关系较近,与国际标准株以及东南亚毒株进化关系统较远.其中HZ08株与国内流行株BJ08和Fuyang08的进化关系最近.HZ08株与C4亚型相关氨基酸序列一致,VP1的抗原性表位发生了变异.结论:HZ08病毒分离株为C4亚型,与Fuyang08和BJ08株进化途径相同,为肠道病毒71型的基因组功能学和疫苗学研究奠定基础.

关键词：肠道病毒71型、全基因组、序列分析

所属期刊栏目：27

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：浙江省医药卫生科技项目2010B027

在线出版日期：2011-12-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：679-682