贵州省3株钩端螺旋体分离株PFGE分型与基因种鉴定

摘要：

目的 应用脉冲场电泳(PFGE)分型技术和16S rRNA基因测序分析技术分别对贵州省3株动物宿主钩端螺旋体分离菌株进行分子分型和基因种鉴定,了解贵州省钩端螺旋体的分子流行病学特征.方法 应用DNA限制性内切酶Not I对钩端螺旋体染色体DNA酶切后,用PFGE将DNA片段分离,采用BionumericsV4.0将3株钩体菌株PFGE图谱与中国15群15型参考菌株进行聚类分析;同时,应用PCR扩增几乎全长的钩体16S rRNA基因片段,并将扩增产物进行双向序列测定,并与GenBank数据库已注册的核酸序列进行同源性比对、确定基因种、分析亲缘进化关系.结果 来自贵州省的3株动物宿主分离钩体菌株PFGE带型命名为LepNot I 002和LepNot I 003,经聚类分析,3株菌株与黄疸出血群黄疸出血型赖株的相似性大于95%.16S rRNA基因测序和分析表明,3株贵州分离钩体菌株之间的同源性为100%,与致病性钩体问号钩端螺旋体种(L.interrogans)不同血清型参考菌株的同源性达100%.结论 3株贵州动物分离钩体菌株经PFGE分型鉴定与黄疸出血群赖型赖株的相似性大于95%,经16S rRNA基因测序分析鉴定为L.interrogans种,上述两种方法对贵州省钩体分离菌株的鉴定结果一致,有助于贵州省钩端螺旋体病的主动监测、暴发调查和传染源追踪.

关键词：钩端螺旋体、PFGE、16S rRNA、序列分析、同源性、基因种

所属期刊栏目：27

分类号：R378.5(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：贵州省优秀科技教育人才省长专项资金项目No.黔省专合字201090号;贵州省疾病预防控制中心青年科学基金项目No.2009-青2-2联合资助

在线出版日期：2011-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：587-591