福建省肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)全基因组核苷酸序列分析

摘要：

目的 了解肠道病毒71型在福建省的遗传背景,追踪EV71流行过程中可能发生的变异.方法 对2010年福建1例手足口病患儿标本中分离到的1株肠道病毒71型分离株(2010FJLY008)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进化分析.结果 2010FJLY008株全长7 403bp,核苷酸及编码氨基酸序列同源性比较,均与08年阜阳流行株Fuyang17.08-2同源性最高,整个基因组核苷酸同源性为98.2%,氨基酸同源性为99.5%;全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析,与Fuyang17.08-2株进化关系较为接近,同属于C4a基因亚型.结论 2010年福建省EV71型病毒流行株(2010FJLY008)在病毒基因组结构、基因组核苷酸同源性比较、编码氨基酸同源性比较、全长基因组核苷酸序列遗传进化分析及VP1区基因遗传进化分析等方面,均与2008年阜阳流行株(Fuyang17.08-2)关系密切,未产生明显的抗原漂移及变异.

关键词：肠道病毒71型、全基因组、核苷酸序列分析

所属期刊栏目：27

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项-突发传染病病原体快速检测与现场机动采样技术平台研究2009ZX10004-106

在线出版日期：2011-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：14-18