福建省甲型H1N1流感病毒分离及首例分离株全基因组序列分析

摘要：

目的 分离甲型H1N1流感病毒,分析福建省首例病毒分离株全基因组序列和遗传特征,为研究病毒进化、致病性、流行规律提供科学依据.方法 采用MDCK细胞和Real-timePCR法进行病毒分离、鉴定;提取病毒RNA,通过RT-PCR扩增其8个基因片段,测定核苷酸序列,利用生物信息软件拼接全基因组序列;分析重要基因位点,利用GENBANK中相关序列对首例病毒分离株A/Fujian/01/2009(H1N1)进行基因进化树分析.结果 从82例甲型H1N1流感确诊病例标本中分离出50株甲型H1N1流感病毒,第一代分离阳性率60.98 %.在福建省首次获得甲型H1N1流感病毒株及全基因组序列.基因组序列分析证明:该毒株与2009年大流行株高度同源,其基因组存在四源重组现象;氨基酸位点分析其对达菲药物敏感,对金刚烷胺类药物耐药;相对于猪流感代表株A/Swine/Iowa/15/1930(H1N1)存在6个HA抗原决定簇位点变异.结论 MDCK细胞对甲型H1N1流感病毒具有较高敏感性;福建省首例甲型H1N1流感病例分离病毒株与北美流行株高度同源;相对于以往古典型猪流感代表株出现了HA蛋白抗原性漂移;为今后进一步开展甲型H1N1流感病毒分子生物学研究奠定基础.

关键词：甲型H1N1流感、病毒分离、全基因组序列、序列分析、进化树

所属期刊栏目：25

分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2009-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：745-748,809