O型口蹄疫病毒蛋白酶编码序列及氨基酸序列变化的分析

摘要：

目的 与方法从GenBank中下载了19株O型口蹄疫病毒的Lab、3C、3D基因,结合本实验室收录的FMDV OA/58 Lab、3C、3D的序列信息,分析比较了三种FMDV蛋白酶(Lpro, 3Cpro, 3Dpol)的编码序列和氨基酸序列.结果 这FMDV具有的蛋白酶的编码序列在突变上没有显著差异(P>0.05),而在氨基酸序列的突变上存在着显著差异(P<0.01).通过多重比较发现Lpro与3Cpro和3Dpol在氨基酸突变上存在差异(P<0.05),而3Cpro和3Dpol之间突变差异不显著.结论 利用Swiss-pdbViewer蛋白质分析软件模拟三种蛋白酶中各个突变热点氨基酸残基的替换,发现突变热点不影响三种蛋白酶的空间结构.这表明病毒基因组在复制过程中的突变只是FMDV变异的原始动力,而FMDV变异的方向性进化动力是感染FMDV的宿主细胞对病毒蛋白酶功能造成的选择压力.

关键词：口蹄疫病毒、病毒蛋白酶、突变

所属期刊栏目：25

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：国家科技支撑计划2006BAD06A14;2006BAD06A10

在线出版日期：2009-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：645-649