10.3969/j.issn.1002-2694.2009.01.002
日本血吸虫信号通路相关基因SjWD101的生物信息学分析及其克隆与表达
目的 利用生物信息学方法分析日本血吸虫SjWD101的结构和功能特征,并利用基因工程技术进行克隆和表达,获得相应的重组蛋白.方法 从日本血吸虫GenBank数据库中筛选WD家族蛋白中全长基因,用相关软件进行生物信息学预测.通过RT-PCR扩增出全长编码区序列,克隆到表达载体pET-28a(+)中,在大肠杆菌BL21中经IPTG诱导表达,表达产物用镍离子金属螯合剂亲和层析柱纯化并经十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和蛋白印迹(Western blotting)鉴定.结果 SjWD101是一个全长1085bp的基因,编码区为66~950,编码294个氨基酸,软件分析表明其理论分子量和等电点分别是31819.7Da和6.44.亚细胞定位分析表明该蛋白是胞浆蛋白,理化性质较稳定.二级结构以反向平行的β折叠为主.含有6个WD40结构域,属于WD蛋白家族中的一员,具有GTP结合蛋白的结构特征.经PCR、双酶切和测序证实pET-28a(+)-SjWD101构建成功.SDS-PAGE和Western blotting证实重组菌成功表达出融合蛋白,经His亲和层析柱获得了纯化的重组蛋白,Western blotting证实WD101重组蛋白能被感染日本血吸虫的兔血清识别.结论 日本血吸虫WD101经生物信息学预测为WD家族蛋白,可能在血吸虫信号转导通路方面有其一定作用,本研究获得了纯化的重组蛋白,为进一步研究其生物学功能奠定了基础.
日本血吸虫、WD40结构域、生物信息学、克隆、表达
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R383.2(医学寄生虫学)
国家自然科学基金30571633
2009-04-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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