Spoligotyping和MLVA用于71株浙江省结核分枝杆菌临床分离株基因分型的初步研究

摘要：

目的 初步探讨寡核苷酸分型(Spoligotyping)和多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)用于浙江省结核分枝杆菌临床分离菌株的分型,以初步了解浙江省结核分枝杆菌的基因型特征.方法 随机选取浙江省结核分枝杆菌临床分离菌株,常规培养,收集菌体,提取基因组DNA.采用聚合酶链反应(PCR)扩增整个DR区进行Spoligotyping分型,同时分别扩增15个VNTR位点进行MLVA分型.聚类分析采用BioNumerics 软件.统计学分析采用卡方检验.结果 对70株菌进行了基因分型,Spoligotyping结果显示,可分为2个基因群,即北京家族 (Beijing family)和非北京家族(Non-Beijing family),分别占70%和30%,49株北京家族菌株中,89.8%为典型北京家族;MLVA结果显示,可分4个基因群,分别为Ⅰ群占8.5%,含5个基因型,Ⅱ群占18.3%,含13个基因型,Ⅲ群占70.4%,含38个基因型,Ⅳ群占2.8%,含2个基因型.两种方法对菌株的基因分型结果非常吻合,Spoligotyping分型为北京家族的菌株均分布在MLVA Ⅲ型中,非北京家族菌株的基因多态性,分属于MLVAⅠ、Ⅱ和Ⅳ型.MLVA将70株菌分为58个基因型(含53个独特基因型),而Spoligotyping只分为18种基因型(含12个独特基因型).结合对临床一线4种药物的耐药检测结果分析,两种方法的分型结果均显示北京家族菌株中表现为全敏感者71.4% (35/49),表现为耐药者为28.6%(14/49);而非北京家族菌株中表现为全敏感者为66.7%,表现为耐药者为33.3%,经卡方检验,两者间的差异无统计学意义 (χ2=0.158,P>0.05).结论 初步证实浙江省结核分枝杆菌存在明显的基因多态性,主要流行型为北京家族.北京家族与耐药无明显相关性.MLVA株水平鉴定能力明显高于Spoligotyping, 尤其是在鉴别北京家族菌株上具有明显的优势.

关键词：结核病、结核分枝杆菌、间隔区寡核苷酸分型、多位点数目可变串联重复序列分析、北京家族、耐药

所属期刊栏目：24

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：浙江省医药卫生科技基金2003B027;国家自然科学基金;"中国结核分枝杆菌基因多态性及其株水平鉴定技术研究"30771853

在线出版日期：2009-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1090-1094