全基因组预测幽门螺杆菌的分泌蛋白

摘要：

目的 运用生物信息学方法预测幽门螺杆菌分泌蛋白,为后续研究奠定基础.方法 用Signalp和TMHMM两个软件对幽门螺杆菌全基因组开放读码框(ORFs)进行预测,Microsoft Access数据库分析处理以识别分泌蛋白,再与HpNCTC 26695二维凝胶电泳质谱鉴定蛋白质组数据库(2DE-MS)和免疫蛋白质组研究结果进行比对验证.结果 从Hp的1587个编码蛋白的ORFs中预测出191种分泌蛋白,其中27个预测蛋白与二维凝胶电泳质谱鉴定(2DE-MS)的Hp蛋白数据库中的蛋白一致;13个预测蛋白出现在高抗原性的免疫蛋白质组中.结论 生物信息学方法可作为研究分泌蛋白的辅助工具,并可为研制Hp诊断试剂和疫苗提供候选抗原.

关键词：幽门螺杆菌、分泌蛋白、信号肤、生物信息学

所属期刊栏目：24

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：福建省科技项目FJGXY04021;福建省教育厅重点项目JA05250;福建省高等学校科技创新团队培育计划基金FMU-RT001

在线出版日期：2008-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：607-611