广东省首例人禽流感H5N1 NS、M和NP基因序列测定及分子进化分析

摘要：

目的 对广东省首例人禽流感H5N1的3个内部基因NP、NS和M进行克隆、测序及遗传进化分析.旨在进一步了解该病毒的来源、遗传变异及其分子进化特征.方法 采集该例死亡患者尸检肺组织标本提取病毒RNA,用RT-PCR二步法进行反转录和基因扩增.产物经TA克隆到载体中进行测序并对结果进行排列、拼接.参照已发表的病毒序列.对基因进行系统进化分析.结果 应用随机引物和自行设计的3对特异性引物扩增出NP、NS和M基因全长cDNA序列.该3个基因同其HA、NA一样均属于A型禽流感病毒,与国内2004-2006年浙江人源病毒及湖南禽源病毒处于同一进化分支.而与香港1997年分离株相距较远.在这3个基因中,NS的变异性最大.宿主特异性相关基因及PDZ结构域配体(PL)基序分析显示其均为禽源基因.结论 感染该病例的H5N1与近年在中国不同省份分离的人禽流感H5N1的系统进化分析显示它们很可能存在共同的祖先,需进一步研究不同来源病毒的亲缘关系以及病毒基因的变化是如何影响病毒的生物学特性、毒力和跨宿主传播的.

关键词：H5N1亚型、基因、遗传进化

所属期刊栏目：24

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广东省科技计划项目资助2005A20901005,2006821101003

在线出版日期：2008-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：597-602