武汉市HIV-1相关基因序列分析及亚型分布

摘要：

目的 研究武汉市HIV感染人群中的HIV毒株的亚型分布特点和流行规律.方法 采集武汉市60名已被确认为HIV-1感染者的抗凝全血样品,提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应方法(nested-PCR) 扩增病毒膜蛋白env 基因的C2-V5区及gag基因的部分区段,对PCR纯化产物直接测序,并应用GCG软件对序列进行分析.结果 通过PCR 扩增得到60份样品的结果,其中env基因序列45份、gag基因序列52份.依据env和gag区基因序列,与HIV-1各个亚型国际参考株比较,通过系统进化分析,最后确定武汉市样品分属5个亚型,分别为HIV-1B亚型中的泰国B(B')亚型32份,流行重组型CRF07-BC 12份,流行重组型CRF01-AE 9份,A 亚型1份和C 亚型6份.结论 武汉市存在多种HIV-1亚型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略.

关键词：艾滋病病毒、基因亚型、套式聚合酶链反应、分子流行病学

所属期刊栏目：23

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2005CB522903

在线出版日期：2008-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1071-1074,1078