3株H9N2亚型禽流感病毒广西分离株全基因组序列的测定与分析

摘要：

目的 对3株H9N2亚型禽流感病毒进行全基因序列的测定与分析.方法根据GenBank公布的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的全基因序列,设计了8对引物,运用RT-PCR 方法获取了3株H9N2亚型AIV广西地方分离株A/Chicken/Guangxi/1/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00的全基因序列,并对所得序列进行了比较分析.结果同源性分析及遗传进化分析发现,所分离的3个毒株的各基因与A/Chicken/Guangdong/4/00和A/Chicken/Jiangsu/1/00的相应基因的核苷酸序列有着较高的同源性和较近的亲缘关系,可能起源于同一种系.所分离毒株中每个毒株的8个基因,在遗传进化树上的分支不具有统一性,说明此3个毒株可能为不同基因亚系间发生自然重排的产物.氨基酸序列比较发现,A/Chicken/Guangxi/1/00、A/Chicken/Guangxi/14/00和A/Chicken/Guangxi/17/00 3株AIV的na基因核苷酸序列在开放性阅读框架的187～195位均缺失了ACAGAGATA共9个核苷酸,它们所编码的氨基酸为T、E、I.3个分离株的HA蛋白第226位氨基酸均为Gln,证明它们为人类非易感性的H9N2亚型AIV.结论此3株H9N2亚型流感病毒为基因自然重排的产物,其na基因均存在缺失,且从分子水平上证明它们对人类不具有易感性.

关键词：禽流感、H9N2亚型、全基因组、测定与分析

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分类号：S852.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西科技攻关项目桂科攻0235001-4;广西留学回国人员科学基金桂科回0236005;广西水产畜牧局科研项目

在线出版日期：2007-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：916-922,926