10.3969/j.issn.1002-2694.2006.04.003
华支睾吸虫CsSP16.4基因的克隆、序列分析和功能预测
目的通过筛选cDNA文库识别华支睾吸虫新基因;克隆并构建重组表达载体,为进一步研究其功能及其应用价值奠定基础.方法对华支睾吸虫cDNA文库进行筛选,通过Blastn程序进行序列比对,识别华支睾吸虫新基因,并应用Motifscan,NCBI Conserved Domain Search 等程序对其进行结构域分析及进化树分析.结果筛选得到的序列长725bp,应用Vecter NTI 分析,理论分子量为16.4kDa,理论等电点(pI)为6.44,疏水氨基酸(AILFWV)占36%,带电荷氨基酸(RKHYCDE)占29%,极性氨基酸 (NCQSTY) 占28.8%,酸性氨基酸(DE) 占8.65%和碱性氨基酸(KR)占9.21%.应用NCBI站点的ORF Finding分析发现其含4个可能的ORF, 其中最长的ORF,从第42到第494 bp,起始密码为ATG、终止密码为TAG,完整阅读框含450 bp,编码150 aa.发现该基因有潜在的2个糖激化位点、3个N肉豆蔻酰化位点和1个蛋白激酶C磷酸化位点.结论确定该基因为华支睾吸虫分泌蛋白基因,为作为诊断候选抗原提供了依据.
华支睾吸虫、分泌蛋白、克隆
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R393.2
广东省科技厅科技计划2004B36001027;广东省科技基金2004-GX-18
2006-05-25(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共3页
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