日本血吸虫7个基因全长cDNA的获取和分析

摘要：

目的从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析全长cDNA序列,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法从构建日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行5'测序获取表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST),在此基础上进行引物延伸法(primer extension)测序,直至获取全长cDNA序列,将获取的基因登录GenBank,并进行生物信息学分析.结果获得7个日本血吸虫全长cDNA序列(GenBank登录号分别为AY336493～AY336499),其中6个为日本血吸虫新基因:类转录因子BTF3(similar to transcription factor BTF3)、延长因子1-α(elongation factor 1-alpha,EF1-α)、富含谷氨酰胺四联重复肽(small glutamine-rich tetratricopeptide,TRP)、鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OA)、内皮差异相关因子1(endothelial differentiation-related factor 1,EDF-1)和类基因转录增强因子(similar to testis enhanced gene transcript protein,TEGT);另1个是精氨酸酶(arginase)基因,比原发现的基因序列长456bp.生物信息学分析发现类基因转录增强因子为跨膜蛋白,具有6个跨膜区;各基因与人、鼠、蟾和曼氏血吸虫等物种的基因有37%～85%的同源性;蛋白结构和功能预测分析显示各基因分别含有NAC基元、精氨酸酶家族特征性序列、TEF基元、TRP基元、转氨酶基元、HTH-XRE基元和NAF位点,预示各基因分别具有相应的功能.结论 EST技术和引物延伸法有助于快速、经济地获取和研究日本血吸虫表达基因.

关键词：日本血吸虫、cDNA文库、基因、生物信息学

所属期刊栏目：20

分类号：R383.2(医学寄生虫学)

资助基金：湖南省卫生厅科研项目2001-Z05

在线出版日期：2005-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1058-1061