日本血吸虫精氨酸酶的cDNA序列分析

摘要：

目的对获得的日本血吸虫(Schistosoma japonicum,Sj)精氨酸酶基因cDNA序列进行二级结构预测。方法采用生物信息学等技术对获得的Sj精氨酸酶编码基因序列进行开放读框(ORF)的寻找，编码氨基酸的推导，蛋白质同源性比较以及二级结构的预测。结果获得的cDNA序列为1 061bp，含有一个840bp的阅读框，编码279个氨基酸，属精氨酸酶家族，与国际蛋白质库中的酵母、蛙、人和大鼠精氨酸酶序列的同源性分别为44%，50%，51%，53%和54%。Sj精氨酸酶氨基酸序列的β转角、亲水性、平均可塑性和无规则卷曲的分布主要出现在N-末端AA残基30～50，70～90和180～200等3个区域，是潜在的抗原表位。结论推测Sj精氨酸氨基酸酶具有较好的抗原性。

关键词：日本血吸虫、精氨酸酶、cDNA序列、抗原表位、生物信息学

所属期刊栏目：17

分类号：R383.2(医学寄生虫学)

资助基金：国家"211"工程建设项目98169;国家自然科学基金30070683

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：22-24