海南省2019-2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因特性

摘要：

目的 了解海南省2019--2020年H3N2亚型流感病毒血凝素基因遗传进化规律与氨基酸变异情况.方法 选取2019-2020监测年度海南省5家流感监测网络实验室分离的16株H3N2亚型流感毒株进行一代全基因组测序,利用MEGA 10.1.8构建血凝素基因系统进化树,并分析氨基酸位点替换情况,应用DNA Star 7.0.1软件进行血凝素基因同源性分析.结果 系统进化树显示,相比于疫苗株A/Kansas/14/2017 (2019-2020),16株H3N2亚型流感病毒分离株血凝素基因在进化树上与疫苗株A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016(2018-2019)亲缘关系更近,属于3C.2a1分支,核苷酸与氨基酸同源性范围分别为98.5％～98.9％、97.9％～98.4％.16株分离株在抗原性位点发生8处氨基酸位点替换,涉及5个抗原决定簇;15株分离株在糖基化位点发生2处缺失.结论 2019--2020年监测年度海南省H3N2亚型流感病毒与2018-2019年疫苗株亲缘关系较近,血凝素蛋白抗原性位点在5个决定簇均有变异,易造成较大流行,WHO推荐的2019-2020年疫苗株保护效果可能不理想.应密切关注H3N2亚型流感病毒的流行与基因变异情况,为流感病毒疫苗株推荐及防控提供科学依据.

关键词：流感病毒、H3N2亚型、HA基因、遗传进化

所属期刊栏目：20

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2020-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：809-813