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10.13604/j.cnki.46-1064/r.2019.06.06

辽宁省结核分枝杆菌可变串联重复序列体系的初步建立

引用
目的 通过对24位点可变串联重复序列(Variable number of tandem repeats,VNTR)和日本12位点VNTR(日本JATA 12位点)的应用,探索适合辽宁省基因分型的相关位点,初步建立本省的VNTR分型体系.方法 采用实验菌株为省级保存的2011-2013年采集自辽宁省14个市的75株菌株.以PCR为基础选取不同位点的引物28对(其中标准24位点与日本JATA12位点中共有的位点有8对)对相应目的片段进行扩增,最后用琼脂糖凝胶电泳进行检测.结果 日本JATA12位点不适用于辽宁省的菌株,12位点中的VNTR2074、VNTR3336和Qub15位点通过多次改变PCR条件进行实践仍未得出准确的条带(杂带过多或无目的条带).标准的24位点中的全部24个位点均可通过实验得出清晰的条带,说明标准24位点的方法可以用于建立辽宁省结核分枝杆菌MIRU-VNTR基因分型体系.75株结核分枝杆菌临床分离株的24个VNTR位点检测结果显示这些菌株均有明显的多态性,24个VNTR位点的Hunter-Gaston指数从0到0.75,其中分辨力最高的位点是MIRU26,分辨力最低的位点是MIRU2.结论 辽宁省与日本虽同为北京基因型的主要流行地区,但辽宁省流行的北京基因型结核分枝杆菌的基因与日本流行的北京基因型结核分枝杆菌存在着不同的特点.24位点MIRU-VNTR基因分型体系适用于本省,目前已初步建立我省VNTR基因分型位点体系,我们将通过进一步的实验精简位点,最终建立最适用于本省的精准VNTR基因分型体系.

结核分枝杆菌、可变串联重复序列、日本JATA12位点、24位点VNTR

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R378.91+1(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))

辽宁省自然科学基金2015020562

2019-07-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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46-1064/R

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