东莞市2015-2016年柯萨奇病毒A6型流行情况及特征分析

摘要：

目的 研究东莞市2015-2016年手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)的流行情况及基因特征.方法 采用RT-PCR方法对HFMD疑似病例标本进行检测,CVA6阳性标本上送广东省疾病预防控制中心,进行病毒分离及鉴定,扩增并测定VP1基因序列.从GenBank中选取其他CVA6代表株进行参考比对,利用DNASTAR软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega4.0.2软件构建亲缘性进化树.结果 在1 145份标本中检出CVA6阳性标本580份,阳性率为50.66％ (580/1 145).序列比对显示,20株CVA6分离株VP1基因之间核苷酸同源性为93.6％～ 100.0％,氨基酸同源性为97.7％～100.0％.东莞市CVA6分离株VP1与近年来全球各地流行株核苷酸和氨基酸的同源性分别为93.4％～98.5％和97.0％～99.7％,与CVA6原型株Gdula以及我国山东省1996年分离株核苷酸和氨基酸相似性仅为82.5％～85.8％和94.1％～96.4％.系统进化树分析显示,2015-2016年东莞地区CVA6与近年来流行于世界各地的CVA6分离株同源性较高,而与原型株进化距离较远.结论 2015-2016年东莞市HFMD病原以CVA6为主,流行株为近年来流行于全国各地的CVA6新变种.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒A6型(CVA6)、进化分析

所属期刊栏目：18

分类号：R512.5(传染病)

在线出版日期：2021-07-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：116-120