珠海市2013年肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型基因特征

摘要：

目的 分析2013年珠海市手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)患者中,肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16)的分子流行病学特征.方法 采集珠海市2013年HFMD临床诊断病例粪便标本215份,选取其中Real time RT-PCR检测EV71病毒核酸阳性的18份和CoxA16病毒核酸阳性的8份标本,进行VP4区基因扩增, 并进行核苷酸序列和遗传进化关系分析.结果 16份EV71扩增测序成功,与C4a基因亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性(95.2％～99.5％)和氨基酸同源性(91.3％～100％);5份CoxA16扩增测序成功,有2份与B2a亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性(98.6％～99.0％)和氨基酸同源性(97.1％～98.5％),3份与B2b亚型代表株具有最高的核苷酸序列同源性(96.6％～97.1％)和氨基酸同源性(100％).结论 2013年珠海市流行的EV71属于C4a基因亚型,CoxA16为B2a和B2b两种基因亚型.

关键词：手足口病、肠道病毒71型、柯萨奇病毒A组16型、基因型

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分类号：R373.2+4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：珠海市卫生局医学科技项目No.2014064

在线出版日期：2015-01-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1429-1434