基于高通道测序的肠道菌群与冠心病的相关性研究

摘要：

背景 冠心病是发达国家及发展中国家最常见的死亡原因之一,肠道菌群的组成在冠心病的病理过程中起重要作用,越来越多证据表明,肠道菌群失调可导致脂质代谢紊乱、低度炎性反应、胰岛素抵抗、血压升高等,进而增加冠心病风险.目的 通过检测冠心病患者肠道菌群结构及多样性,了解其肠道菌群特点,进一步寻找冠心病危险因素,为冠心病患者提供新的诊疗方法.方法 选取2016年7月—2017年6月入住新乡医学院第一附属医院心血管内科及心脏重症监护病房(CCU)的冠心病患者62例,应用Gensini评分将其分为轻度组27例,中重度组35例;同时选取同期于本院体检的30例健康者作为对照组.采集研究对象的粪便样本,提取粪便样本的DNA并对其进行细菌16S rDNA V3区的聚合酶链式反应(PCR)扩增,对最终的PCR扩增产物进行生物信息学分析.结果三组原始PE reads数目(PE_reads)、去除嵌合体后有效序列数目(Nochimera)、有效序列平均长度(AvgLen)、有效数据的GC百分比含量(GC)、Nochimera与PE_reads的百分比(Effective)比较,差异均无统计学意义(P>0.05).三组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数比较,差异均有统计学意义(P<0.05);其中,轻度组与中重度组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数均低于对照组(P<0.05).三组拟杆菌门、变形菌门相对丰度比较,差异均有统计学意义(P<0.05),其中中重度组拟杆菌门相对丰度低于对照组,变形菌门相对丰度高于对照组(P<0.05);三组拟杆菌纲、梭菌纲相对丰度比较,差异均有统计学意义(P<0.05),其中中重度组拟杆菌纲相对丰度低于轻度组、梭菌纲相对丰度高于轻度组,轻度组拟杆菌纲相对丰度低于对照组、梭菌纲相对丰度高于对照组(P<0.05);三组拟杆菌属相对丰度比较,差异有统计学意义(P<0.05),其中中重度组相对丰度低于轻度组和对照组,轻度组相对丰度低于对照组(P<0.05).Metastats差异分析结果显示对照组与轻度组拟杆菌属、巴斯德菌属、脱磷弧菌属、埃希杆菌-志贺杆菌属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义(P<0.05);对照组与中重度组巴斯德菌属、Dialister属、黄杆菌属、Parasutterella属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义(P<0.05);轻度组与中重度组脱磷弧菌属、Dialister属、埃希杆菌-志贺杆菌属、黄杆菌属、帕拉普菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义(P<0.05).结论 肠道菌群多样性、结构的改变,是冠心病的危险因素,因此调节肠道菌群、粪菌移植等方法可能成为冠心病新的治疗方法.

关键词：冠心病、生物多样性、计算生物学、肠道菌群、多位点测序分型

所属期刊栏目：22

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：新乡市科技攻关课题CXGG16012

在线出版日期：2019-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：3554-3560