Toll样受体信号通路与冠心病关系的生物信息学分析

摘要：

背景 冠心病严重威胁着中老年人的健康,在其发生、发展以及预后过程中炎症和免疫反应起着非常重要的作用.而Toll样受体(TLRs)能够介导天然免疫和获得性免疫反应,已有研究表明TLR2和TLR4信号通路与冠心病关系密切,但整个TLRs信号通路及其他亚型与冠心病的关系还有待进一步研究.目的 研究TLRs信号通路及其亚型与冠心病的关系,以利于深入研究TLRs信号通路与冠心病的关系,发现新的冠心病相关蛋白,为研发治疗冠心病的药物提供新的候选靶点.方法 2016年3月—2018年2月,基于GO数据库,利用语义相似性方法进行基因集合间功能的一致性分析,获得TLRs信号通路与冠心病的关系.利用蛋白互作网分析待测蛋白质的功能,根据与待测蛋白质互作的已知冠心病相关蛋白的数目,确定TLRs各亚型与冠心病的关系.结果 京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库的7类系统信号通路中,免疫系统信号通路的相似性得分最高.TLRs信号通路基因集合与冠心病基因集合功能相似性得分高于随机情况下两个基因集合的功能相似性得分(P<0.05).14条免疫系统的信号通路中,TLRs信号通路的功能相似性得分最高.通过蛋白互作网的分析,发现除已知的TLR2、TLR4外,TLR10也与冠心病相关蛋白互作密切.结论 TLRs信号通路与冠心病关系密切,而TLRs家族可能是冠心病防治的新靶点,其中TLR10可能是新的冠心病相关蛋白.

关键词：冠心病、Toll样受体、计算生物学、语义相似性、蛋白质相互作用图

所属期刊栏目：22

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：分子发育生物学国家重点实验室2017年开放课题2018-MDB-KF-07;大同市应用基础研究计划项目2017134;山西大同大学博士科研启动费资助项目2016-B-01;山西大同大学校级重点建设学科内科学资助项目100201

在线出版日期：2019-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2069-2074