云南省一株近全长HIV独特重组毒株(CRF01_AE/B/C)的重组模式分析

摘要：

目的 通过分析云南省一株HIV-1独特重组毒株的基因结构和重组特点了解云南省独特重组毒株的演变情况.方法 对云南省艾滋病关爱中心抗病毒治疗的耐药患者进行耐药监测后,从耐药监测序列库中200条序列进行全长扩增,扩增成功后选取具有代表性的独特二代重组毒株进行研究.采集血浆500 μL,分离血浆并提取纯化血浆中的RNA.全长序列分为三个部分,运用RT-PCR的方法分别扩增该病毒基因的3'半分子,gag区和pol区,扩增产物测序后获得该毒株近全长基因序列.用Genotyping、BLAST、RIP和jpHMM在线分析工具和Simplot3.5软件进行重组分析.结果 获得8 850 bp近全长HIV-1基因序列,重组分析显示,该条序列是以C亚型为骨架,B(B')和C亚型作为片段插入的一条位置重组毒株,该条序列共有10个重组断点将序列分为11个片段,其中5个为C片段,4个B片段,2个CRF01_AE片段.结论 云南省HIV-1URF的多样性不断演变,尤其是以C、B(B')和CRF01_AE亚型的二代重组,需要持续监测,以应对诊断、抗逆转录病毒治疗和预防方面日益增加的挑战.

关键词：人类免疫缺陷病毒-1、独特重组型、近全长基因序列

所属期刊栏目：36

分类号：R512.91(传染病)

资助基金：云南省高层次卫生技术人才培养经费资助项目;云南省艾滋病病毒学及临床诊疗技术创新研究中心;国家自然科学基金;云南省教育厅科学研究基金项目

在线出版日期：2022-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：898-904