利用概率估算提高植物品种分子标记鉴定的准确率

摘要：

[目的]植物品种分子标记鉴定标准只抽检了基因组上部分标记位点,存在抽样误差,鉴定结论常常因此被质疑.估计植物品种分子标记鉴定位点的抽样误差与鉴定结论的可靠性,为品种分子鉴定标准的应用提供科学依据.[方法]以2个品种间观察到的差异位点的数目为条件,根据贝叶斯公式建立品种间真实差异位点数目的条件概率模型.根据观察到的差异位点的数目服从于二项分布,且真实差异位点数的先验概率近似于均匀分布的特点,实现条件概率模型的计算.根据概率模型获得的概率保障的大小,将品种间的关系划分为红区、绿区和黄区,对应相同或近似品种、不同品种和待定品种.利用8个水稻品种的3 205个SSR分子标记位点的分型结果,估计2个品种组合间的真实差异水平,进而判定品种间关系的真实值.对每一对品种进行10 000次的分子标记位点的模拟抽样,每次抽取48个SSR标记位点.根据每次模拟抽样的结果,按概率模型计算概率并判定品种间的关系,将判定结论与真实值比较,验证概率模型的准确性.最后,利用概率模型为近期的西瓜品种侵权案的判决结论提供概率支持.[结果]在模拟抽样的验证试验中,每个品种组合有4 295-10 000次随机抽样在95％的概率保障下,判定为不同品种.与品种间的真实关系比较表明,利用概率模型鉴定的水稻品种间关系的正确率为100％.最后,利用概率模型为最近的西瓜品种侵权案的判决结论的正确性提供了95％以上概率保障,败诉方对抽样位点不足导致判决不可靠的质疑理由并不充分.[结论]构建了一个评估品种间关系、判定结论可靠性的概率模型,为品种间关系的分子鉴定结论赋予了概率保证,提高品种间关系判定结论的准确性,避免因检测位点不足导致的争议.

关键词：品种鉴定、分子标记、抽样误差

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资助基金：生物产业共性技术标准研究2016YFF0202300;湖北省自然科学基金青年科学2017CFB229

在线出版日期：2018-06-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1013-1019