烟草叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析

摘要：

”目的”构建烟草叶片全长cDNA文库并测序,发掘与烟叶发育、代谢和抗逆相关的基因,为进一步研究功能基因奠定基础,”方法”以烟草苗期叶片为试验材料,利用改进的Cap-trapper法构建烟草叶片全长cDNA文库.利用测序技术获得大量的EST序列,采用生物信息分析手段,对所测EST进行拼接和功能注释.”结果”构建了烟草叶片的全长cDNA文库,该文库滴度为1.2x106pfu·mL-1,平均插入片段在1.4kb左右.利用该文库测序了5280个克隆,获得5233条高质量表达序列标签(EST),序列拼接出3922个单一基因；同源比对分析表明,89.7％的基因与已知功能基因具有较高的同源性,这些基因涉及细胞生长、信号转导、翻译合成、抗逆反应和能量代谢等功能；并详细鉴定了部分与烟碱合成和抗病相关的基因.”结论”通过Cap-trapper法成功构建了高质量的烟草幼苗叶片全长cDNA文库；大规模EST测序分析挖掘到大量与烟草幼苗叶片发育、抗逆、抗病、烟碱代谢相关的候选基因.

关键词：烟草、全长cDNA文库、表达序列标签、功能注释

所属期刊栏目：45

分类号：S435.621.2(病虫害及其防治)

资助基金：国家烟草专卖局项目110200701021;国家烟草专卖局项目110200701022

在线出版日期：2012-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1696-1702