利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性

摘要：

”目的”通过中国粳稻地方品种的遗传多样性分析,阐明各省份粳稻地方品种的遗传结构及其亲缘关系,为中国粳稻杂交育种的亲本选配提供科学依据.”方法”利用43对SSR多态性标记,对原产于中国17个省(市、自治区)的187份粳稻地方品种进行等位基因多样性、遗传结构和聚类分析.”结果”共检测到等位基因351个,每个位点等位基因变幅为2-21,平均每个位点等位基因数为8.2;基因多样性指数变异范围为0.117-0.908,平均为0.550;多态信息含量(PIC)变异范围为0.114-0.902,平均为0.523.在RM72、RM241、RM219、RM412和RM232等位点所检测到的遗传多样性参数值较大.西南、华南、华中粳稻地方品种的遗传多样性明显高于华北和东北地区;云南省粳稻地方品种遗传多样性最丰富,天津和吉林的粳稻地方品种的遗传多样性相对较低.基于Nei”s遗传距离的系统聚类把供试材料分为8个小类群,南方粳稻地方品种主要聚类于第i、ii、iii、iv和v等5个小类群,北方粳稻地方品种主要聚类于第vi、vii和viii等3个小类群.基于模型的群体结构分析,供试材料被分为11个亚群,有144份材料被分到相应的11个亚群,其余43份材料被分到混合亚群.”结论”南方稻区粳稻地方品种的遗传多样性明显高于北方稻区,其中西南稻区的粳稻地方品种遗传多样性最为丰富,而云南是粳稻地方品种遗传多样性最丰富的省份.北方与南方粳稻地方品种间存在较大的遗传差异,粳稻地方品种间亲缘关系与地域性存在一定的相关性,这种相关性在北方粳稻地方品种中更为突出.RM72、RM241、RM219、RM412和RM232适合应用于粳稻地方品种的遗传多样性检测.

关键词：粳稻、地方品种、遗传多样性、遗传结构

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分类号：S511.22(禾谷类作物)

资助基金：国家重点基础研究发展计划”973”计划项目2010CB125904-5;作物种质资源保护项目NB2010-2130135-25-01;国家”十一五”科技支撑计划项目2006BAD13B01

在线出版日期：2012-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：405-413