玉米矮花叶病毒分离物基因组克隆及多样性分析

摘要：

玉米是重要的粮食和经济作物,在国民经济中占有重要地位.玉米矮花叶病毒(Sugercan mosaic virus,SCMV)广泛分布在世界各玉米主产区,严重威胁玉米的安全生产.系统研究SCMV的发生危害、遗传结构与进化机制,对病毒病的防治具有重要意义.从山西省4个玉米主产区采集122个玉米叶片样品(2015年62份,2016年60份).经RT-PCR检测证实36个样品(2015年20个样品,2016年16个样品)为SCMV阳性,且广泛分布于山西省玉米各个产区.从这些阳性样品中分离、测序、克隆得到了一个新的SCMV分离物,该分离物(包括5'-UTR和3'-UTR端)基因组全长9 539 bp,编码3 063个氨基酸.该分离物与26个SCMV分离物(NCBI)进行一致率、系统发育分析表明SCMV存在较大遗传变异,27个分离物被划分为3个与地理位置无明显相关性的不同进化群体.选择压力分析表明,负向选择可能是SCMV遗传变异的原因之一.对变异位点统计分析发现,该结果将为评估SCMV在中国的流行病学特征奠定基础,有助于SCMV的长期可持续防控策略的制定.

关键词：玉米、SCMV、基因组、多样性

所属期刊栏目：21

分类号：S435.131;Q78(病虫害及其防治)

资助基金：山西省农业科学院植物保护研究所重点实验室开放性课题项目YHSW2016001

在线出版日期：2019-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：36-43