水稻纹枯病菌MAPK级联信号途径分析及信号通路模型预测
MAPK级联信号途径在植物病原真菌的生长、发育、繁殖及致病性等方面起着重要作用.根据已公布的5个水稻纹枯病菌(Rhizoctonia solani)全基因组数据利用生物信息学方法对该病原菌的MAPK(mitogen-activated protein kinase)级联信号途径基因进行了鉴定,并预测水稻纹枯病菌MAPK级联途径图.蛋白结构域和motif分析结果表明,水稻纹枯病菌的MAPK信号途径基因均含有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶结构域,并且基因序列具有较高保守性.多重序列比对结果表明,水稻纹枯病菌基因组中存在11个MAPKKK基因,分属于Ste 11、Bck1和Ssk2类;10个MAPKK基因,分别为Ste7、Pbs2及Mkkl类;12个MAPK基因,被分类为Kss1/Fus3、Hog1、Slt2和Ime2.在5个水稻纹枯病菌基因组中,水稻纹枯病菌(taxid:456999)和AG-3 Rhs 1 AP(taxid:1086054)基因组中存在Kss1/Fus3-MAPK、Hog1-MAPK、Slt2-MAPK和Ime2-MAPK信号通路,AG-1 IB(taxid:1108050)基因组中存在Kss1/Fus3-MAPK、Hog1-MAPK和Slt2-MAPK通路,AG-8 WAC10335(taxid:1287689)基因组中仅存在Hog1-MAPK通路,而AG-1 IA(taxid:983506)基因组中只有2个MAPKKK基因未找到完整的信号通路.依据上述研究结果预测了水稻纹枯病菌的Kss1/Fus3、Hog1、Slt2和Ime2级联途径模型,此结果为深入研究水稻纹枯病菌的MAPK家族功能奠定了重要的理论基础.
水稻纹枯病菌、MAPK级联途径、全基因组、信号通路模型
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Q78(基因工程(遗传工程))
黑龙江省自然基金项目C201321
2018-01-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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