10.13798/j.issn.1009-153X.2023.06.010
iTRAQ技术在颅内动脉瘤病人血浆差异表达蛋白检测中的应用
目的 探讨同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术在颅内动脉瘤血浆差异表达蛋白(DEPs)检测中的应用价值.方法 收集2019年1~12月收治的10例颅内破裂动脉瘤病人血浆10份,同时收集年龄、性别、吸烟史、饮酒史、高血压以及动脉瘤位置等相匹配的10例颅内未破裂动脉瘤血浆10份作为对照组.采用iTRAQ技术筛选血浆样本DEPs,应用生信分析方法GO分析和KEGG通路富集分析,并与GEO数据库的数据集进行交叉验证.结果 经蛋白质组学分析鉴定出806个可定量蛋白,其中DEPs共122个,表达上调59个,表达下调63个.GO和KEGG分析结果显示,动脉瘤破裂主要与炎症和免疫反应相关.DEPs相互作用网络分析显示,白蛋白、血红蛋白β亚基、钙调蛋白1、转铁蛋白和载脂蛋白A1是网络核心蛋白.与GEO数据集交叉结果显示,血浆样本SLMAP、IQGAP3、PTPRJ、PEBP1、S100P、BASP1和AOC3等表达水平与GEO数据集的动脉瘤组织基因表达水平呈现相同变化趋势,而且破裂动脉瘤与未破裂动脉瘤之间具有统计学差异(P<0.05).结论 本文结果初步筛选出与颅内动脉瘤破裂相关的血浆DEPs,这些DEPs与炎症和免疫反应密切相关.这为研究颅内动脉瘤发病的分子机制和潜在的治疗靶点提供了新的线索.
颅内动脉瘤、蛋白质组学、差异表达蛋白、同位素标记相对和绝对定量技术、生物信息学
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R743.9;Q786(神经病学与精神病学)
沈阳市公共卫生科技专项20-205-4-098
2023-07-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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