利用RNA-Seq技术研究小麦芒长发育相关基因

摘要：

芒是小麦穗部重要的形态和光合器官,位于5A染色体长臂的小麦B1基因抑制小麦穗中下部的芒长发育.本研究以一对芒长存在差异的近等基因系SN051-1(有芒b1b1)和SN051-2(无芒B1B1)及其F1(无芒B1b1)、F2有芒植株(b1b1)和无芒植株(B1B1、B1b1)为研究材料,利用RNA-Seq技术对芒的发育相关基因进行研究.转录组测序结果共得到Clean data总碱基数为48.06 Gbp,Q30均在85.01％以上;在亲本SN051-1(有芒b1b1)和SN051-2(无芒B1B1)以及F1(无芒B1b1)中共获得180个共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中在无芒材料中表达上调的有56个差异基因,表达量下调的有134个差异基因;引入F2(无芒B1B1、B1b1,有芒b1b1)结果得到22个共同差异表达基因,其中在无芒材料中表达上调的有4个差异基因,表达量下调的有18个差异基因;对在无芒材料中表达上调的4个差异基因进行实时荧光定量PCR(real time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR),结果表明c18073.graph_c0、c55090.graph_c0和c73118.graph_c0等3个基因的基因表达模式与RNA-Seq结果基本相符.

关键词：作物育种学与良种繁育学、小麦、芒、近等基因系、RNA-Seq、实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：9

分类号：S512.1+1(禾谷类作物)

资助基金：高等学校博士学科点专项科研基金20113702120013

在线出版日期：2021-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1530-1540