家蚕JAK-STAT信号通路调控的基因预测
研究通过生物信息学分析预测了Janus激酶信号转导和转录激活子(Janus kinase/signal transducer and activator oftranscription,JAK-STAT)信号通路调控的基因.从家蚕基因组数据库中下载所有预测基因,通过扫描搜索启动子区域(1000 bp)的STAT结合序列TTCN2-4GAA发现:家蚕的9293个基因编码7271个非冗余蛋白,其基因的启动子序列中存在1～6个靶序列.基因本体论(gene ontology,GO)注释的结果显示:这些蛋白质参与细胞组成、分子功能和生物学过程,表明JAK-STAT通路对很多基因发挥调节作用.靶基因中超过50％的基因与结合相关,约40％的基因与细胞过程、代谢过程和催化活性相关.通常认为JAK-STAT通路在免疫反应中也发挥作用,在一些与抗病毒因子、细胞免疫效应和小分子抗菌肽(如防卫素、攻击素、moricin和葛佬素蛋白3)等相关基因的启动子区域可以检测到1～4个STAT结合靶序列,暗示一些抗病毒因子、细胞免疫效应物和抗病毒活性相关的抗菌肽表达可能由JAK-STAT信号通路调控.
分子生物学、Janus激酶信号转导和转录激活子通路、家蚕、基因本体论注释、免疫反应
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S881.2(蚕桑)
高等学校博士学科点专项科研基金;国家自然科学基金;国家重点基础研究发展计划（973计划）
2021-11-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
445-452
