肠道病毒71型重症患儿分离株SDLY96的全基因组序列分析

摘要：

目的:对肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)重症患儿分离株SDLY96进行全基因组序列测定与分析,为构建EV71感染性克隆奠定基础.方法:利用RT-PCR对2010年山东临沂1例手足口病(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)重症患儿标本分离到的EV71型分离株(SDLY96)进行全基因组核苷酸序列测定,并对基因组序列进行同源性比较及遗传进化分析.结果:SDLY96株基因组全长7405个核苷酸,SDLY96株与Fuyang株EU703813的核苷酸及氨基酸序列同源性均最高,整个基因组核苷酸同源性为98.4％,氨基酸同源性为99.1％.基于VP1区的基因遗传进化分析显示,SDLY96株与Fuyang株EU703813进化关系最为接近.结论:SDLY96株属EV71病毒的C4基因亚型的C4a分支,与Fuyang株的核苷酸及氨基酸序列同源性很高.

关键词：卫生检验学、肠道病毒71型、序列分析、全基因组

所属期刊栏目：6

分类号：R1(预防医学、卫生学)

资助基金：国家自然科学基金;山东省自然科学基金;高等学校博士学科点专项科研基金新教师类;山东大学公共卫生学院青年人才创新基金

在线出版日期：2021-11-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1014-1020