10.3969/j.issn.1006-9771.2018.03.001
老年肌肉衰减综合征基因表达性别差异的生物信息学分析
目的 利用生物信息学方法对男女肌肉衰减综合征患者与正常人群进行差异基因分析,研究肌肉衰减个体骨骼肌细胞基因表达在性别间的差异.方法 从Gene Expression Omnibus数据库下载老年肌肉衰减综合征相关数据集,采用BRB-Array Tools及STRING软件在线分析,利用Cytoscape软件进行蛋白质相互作用网络分析.结果 男性差异表达基因219个,其中高表达152个,低表达67个;女性差异表达基因142个,其中高表达90个,低表达52个;共同高表达47个,共同低表达21个.基因本体(GO)分析显示,女性肌肉衰减综合征患者差异基因涉及的GO类别较多,共同的富集模块为脂肪细胞的分化调节、蛋白激酶抑制剂活性、蛋白激酶调节剂活性等.抗肌萎缩蛋白、波形蛋白和原肌球蛋白α-3链是男性蛋白质相互作用网络中重要节点,而金属硫蛋白1H、动力蛋白轻链为女性的重要节点.结论 老年肌肉衰减综合征发生机制存在性别差异.针对各自重要节点的后续研究可能对老年肌肉衰减综合征的发生机制及并发症的研究起重要作用.
肌肉衰减综合征、老年、性别、蛋白质相互作用网络、生物信息学
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R685(骨科学(运动系疾病、矫形外科学))
国家自然科学基金面上项目81373755;国家自然科学基金青年科学基金项目No.81403470National Natural Science Foundation of ChinaGeneral81373755;National Natural Science Foundation of ChinaYouth81403470
2018-05-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
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