广州管圆线虫线粒体COX1基因碱基置换饱和度分析
目的 检测广州管圆线虫线粒体COX1基因碱基置换饱和度. 方法 收集全国33个采样点的广州管圆线虫成虫130条,对其COX1基因全长进行PCR扩增和测序,拼接、比对后,利用DnaSP软件分析序列的碱基多样性、单倍型数量和突变位点,根据碱基颠换和碱基转换随遗传距离增加的变化趋势判断COX1基因饱和度.结果 共获得130个COX1全长序列,长度均为1 577 bp,碱基突变位点为171个,占10.8％,核苷酸多态性为0.02841.突变的空间分布无明显聚集性,均匀分布于整条DNA链上.其中单倍型39个,多态性为0.8114.单倍型两两比较发现,随遗传距离增加,广州管圆线虫的COX1基因碱基转换突变和颠换突变均呈直线上升,且转换数量多于颠换数量,增加速率分别为0.76和0.16,碱基置换未饱和;不同氨基酸密码子位点碱基置换速率差异较大,速率最大的为第三位点,其次为第一位点,最小的为第二位点.后圆线虫总科(Metastrongyloidea)7种线虫的COX1基因饱和度分析显示,遗传距离约为0.15时,碱基颠换数量开始超过转换数量.将本研究所获COX1基因序列与后圆线虫总科COX1基因综合分析,结果表明,碱基转换的比例在6％时出现平台期,而碱基颠换仍直线增加.结论 广州管圆线虫线粒体COX1基因碱基置换未饱和.
广州管圆线虫、线粒体基因、COX1、置换、饱和度
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R383.1(医学寄生虫学)
2014-08-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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