基于GBS简化基因组技术的我国家养雉鸡系统发育分析

摘要：

为分析我国家养雉鸡遗传背景和起源进化关系,采用高通量简化基因组测序方法对我国家养6个雉鸡群体(美国七彩雉鸡、蒙古雉鸡、黑化雉鸡、白羽雉鸡、绿雉鸡、申鸿七彩雉)的分类起源关系进行分析.结果表明:获得雉鸡Clean base数据分别为330.44×106 Gb,340.64×106 Gb,348.50×106 Gb,291.67×106 Gb,286.44×106 Gb 和 324.98×106 Gb,Q20≥92％、Q30≥85％,GC分布正常,共挖掘到50078个有效SNP位点.通过系统进化树、主成分和群体遗传结构分析,6个雉鸡种群可分为两大类,申鸿七彩雉、黑化雉鸡、白羽雉鸡、绿雉鸡和美国七彩雉鸡为一类,蒙古雉鸡单独为一类.研究揭示家养雉鸡种群在长期的养殖过程中存在基因交流.

关键词：雉鸡、GBS、SNP、遗传多样性、系统发育

所属期刊栏目：45

分类号：S839.2(家禽)

资助基金：国家科技基础条件平台建设计划TZDWZYK2019-07

在线出版日期：2023-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：15-19