中国鸭源H5N6AIV血凝素和神经氨酸酶基因特征及遗传进化分析

摘要：

为明确中国鸭源H5N6 AIV的HA和NA基因特征及其遗传变异情况,研究选取了NCBI流感病毒资源库里的32株具有完整ORF编码区的中国鸭源H5N6 AIV的HA和NA基因序列,利用分子生物学软件分析其HA和NA基因特征及其遗传进化情况.结果 显示,中国鸭源H5N6 AIV的HA裂解位点有REKRRKR、↓G、RERRRKR ↓ G和KEKRRKR↓G三种类型,HA有6个潜在的N-糖基化位点,其中第182、222、224位氨基酸依次为N、Q、G,具有与禽源唾液酸α-2,3受体结合的特性,然而HA发生了S123P/T、T156A、S223R氨基酸位点突变,部分毒株发生了I151T氨基酸位点突变;HA基因核苷酸遗传进化分析显示,中国鸭源H5N6 AIV遗传进化上均处于clade2.3.4.4分支,并进一步进化出Ⅰ和Ⅱ两个亚分支.部分中国鸭源H5N6 AIV NA第59～69位缺失11个氨基酸,中国鸭源H5N6 AIV NA基因遗传进化上分为两个大的分支,分别对应NA基因颈部缺失型和完整型两种类型;NA颈部完整型的NA有6个潜在的N-糖基化位点,NA颈部缺失型的NA由于第59～69位氨基酸的缺失,导致其第67位丢失了一个N-糖基化位点.研究为中国鸭源H5N6 AIV的生物学特性和遗传进化特征研究奠定基础.

关键词：鸭、H5N6亚型禽流感病毒、血凝素、神经氨酸酶、基因特征、遗传进化

所属期刊栏目：42

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：福建省省属公益类科研院所基本科研业务费专项;福建省省属公益类科研院所基本科研业务费专项;现代农业产业技术体系建设专项;福建省自然科学基金;福建省财政专项

在线出版日期：2020-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：21-27