一株鸭源H6N6亚型禽流感病毒的基因组测序及遗传进化分析

摘要：

对2016年分离自华东地区某活禽交易市场的一株鸭源H6N6亚型禽流感病毒A/duck/Anhui/D0642/2016(H6N6)进行了全基因组序列扩增和测序,以及序列同源性比对和遗传进化分析.结果显示,该分离株的HA基因与野禽源病毒Mturtledove/Wuhan/HKBJ62/2015(H6N6)的核苷酸一致性最高,推导的裂解位点处氨基酸基序为P-Q-I-E-T-R-G,符合低致病性禽流感病毒的分子特征;NA基因无茎部缺失,与早期分离株A/duck/Fujian/6159/2007(H6N6)具有最高的核苷酸相似性;内部基因中,仅NP基因与H6N2亚型禽流感分离株的核苷酸相似性最高,PB2、PB1、PA、NS和NS基因均与近几年的H6N6亚型病毒关系紧密.进一步的分析表明,D0642株的8个基因片段均属于欧亚进化谱系,可能由H6N6和H6N2亚型重组产生;并且NA和PB2基因还与当前国内优势流行的2.3.4.4分支H5N6亚型禽流感病毒关系密切,可以为其在自然界的进一步重组提供基因片段的来源.因此,须加强对H6亚型禽流感病毒的流行病学监测.

关键词：禽流感病毒、H6N6、基因组、遗传进化、2.3.4.4分支H5N6

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分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划;国家重点研发计划;“十二五”国家科技计划农村领域项目;江苏高校优势学科建设工程项目

在线出版日期：2017-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：21-28