鸭源新城疫病毒SS1株全基因序列测定及遗传进化分析

摘要：

对从贵州省某三穗鸭养殖场病死鸭体内分离的1株新城疫病毒(NDV)Sheldrake duck/China/Guizhou/SS1/2014(简称SS1株)进行部分生物学特性测定及全基因测序与分析.结果表明:SS1株的MDT、ICPI和IVPI分别为52 h、1.89和2.80,F基因编码蛋白的裂解位点序列为112R-R-Q-K-R-F117,HN基因编码571个氨基酸,均符合NDV强毒株特征;SS1株基因组全长为15 192 bp,各基因片段核苷酸序列与代表性基因Ⅶ型毒株ZJ1、NA-1、SF02和FP1/02相似性最高,达96.3％～98.7％,而与疫苗株V4、La Sota和Mukteswar同源性最低,为82.8％～85.4％;根据F基因序列绘制的系统进化树显示SS1株属于ClassⅡ基因Ⅶd亚型.F和HN蛋白氨基酸序列分析发现,SS1株F蛋白中和抗原位点第170位氨基酸、HN蛋白抗原区及其邻近氨基酸位点与国内当前流行的基因Ⅶd亚型NDV毒株一致,而与疫苗株有较大的差异.此外,交叉血凝抑制试验结果表明,SS1株与传统疫苗株La Sota的抗原同源性为84.5％,而与新型基因Ⅶ型疫苗株A-Ⅶ的抗原同源性为100％,表明分离株与疫苗株存在一定的抗原差异.

关键词：三穗鸭、新城疫病毒、全基因测序、遗传进化

所属期刊栏目：38

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：教育部促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目;公益性行业农业科研专项;贵州省省校合作项目;贵州大学引进人才科研项目

在线出版日期：2016-07-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：51-55