应用RNA-seq技术优化鸭基因结构及预测新转录本

摘要：

鸭基因组草图虽然已经释放,但其基因注释很不完善.基于此,本文应用前期得到的RNA-seq数据开展了鸭基因结构优化和新转录本预测等工作.基因结构优化结果显示,5'和3'端得到延长的基因数目分别为3 878个和3 895个,其平均延伸长度分别为198 bps和246 bps.新转录本预测共得到8 141个新转录本,大部分新转录本平均长度大于3000bps,单个新转录本平均由9个以上的片段组成.同时,70％左右的新转录本具有编码能力.本研究优化了大量鸭基因结构信息并挖掘了许多潜在的新基因,为鸭基因组的进一步完善提供基础数据.

关键词：RNA-seq、基因结构优化、新基因预测、鸭

所属期刊栏目：37

分类号：S834.2(家禽)

资助基金：现代农业产业技术体系CARS-43-42

在线出版日期：2015-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：5-8