基于高通量测序分析早期新生儿肠道和咽部微生物菌群

摘要：

目的 初步探讨早期新生儿肠道和咽部微生物群的分布特点及相关性.方法 选取上海市浦东新区妇幼保健院2021年9月—2022年1月出生的混合喂养的足月健康新生儿为研究对象.采用16S rRNA基因测序技术分析新生儿出生当天及出生后5～7 d的粪便和咽拭子样本,分析比较早期新生儿肠道和咽部微生物群的组成及功能差异.结果 多样性分析表明,早期新生儿咽部微生物群的多样性高于肠道,但差异无统计学意义(P>0.05).门水平上,出生当天肠道变形菌门相对丰度高于咽部(P<0.05);出生后5～7 d肠道放线菌门和变形菌门相对丰度高于咽部、厚壁菌门相对丰度低于咽部(P<0.05).属水平上,出生当天肠道和咽部的优势菌属组成差异无统计学意义(P>0.05);出生后5～7 d肠道和咽部的链球菌属、葡萄球菌属、罗氏菌属、双歧杆菌属及埃希菌-志贺菌属等共生菌差异有统计学意义(P<0.05).直系同源序列聚类数据库分析显示,咽部菌群更多地集中在染色质结构和动力学及细胞骨架上,而肠道菌群在RNA加工修饰、能量生成和转换、氨基酸转运代谢、碳水化合物转运代谢、辅酶转运和代谢等方面表现丰富(P<0.05).京都基因和基因组百科全书分析显示,与咽部菌群相比,肠道菌群对细胞运动、细胞进程和信号转导、内分泌系统、排泄系统、免疫系统、代谢性疾病、神经系统和转录功能参数的预测程度更高(P<0.05).结论 新生儿出生时肠道和咽部的微生物群组成及多样性无显著差异,随着出生时间的推移,两个生态位的微生物群组成开始出现分化,并逐渐显现出各自不同的功能.

关键词：肠道菌群、咽部菌群、肠-肺轴、16S rRNA测序、新生儿

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分类号：S816.7;X703.1;TS201.3

资助基金：江苏省妇幼健康重点人才苏卫办妇幼号

在线出版日期：2023-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：508-515