10.3969/j.issn.1007-3639.2007.09.008
WCX2蛋白芯片筛选食管鳞癌血清标志蛋白的研究
背景与目的:蛋白质组学研究有助于筛选食管上皮癌变相关的分子变化.本研究通过比较食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者和正常对照血清蛋白表达谱的差异,来筛选食管鳞癌相关血清蛋白标志物,为筛选和建立食管鳞癌早期诊断的血清学指标提供依据.方法:应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,采用弱阳离子交换芯片(WCX2)首先对训练组44对食管鳞癌患者和性别年龄匹配的正常对照血清蛋白表达谱的差异进行了分析,建立决策树分类模型后,对测试组进行盲法验证.结果:在质荷比(M/Z)2 000~20 000范围内,共检测到84个有效蛋白峰,其中28个峰差异有显著性(P<0.05).自动选用M/Z为2 545、3 371、3 746、5 009、5 021和15 886的6个差异蛋白峰,建立食管鳞癌决策树分类模型,其灵敏度为93.18%(41/44),特异度为97.73%(43/44).对测试组进行双盲检测,结果显示灵敏度和特异度分别为77.27%(34/44)和75.00%(33/44).结论:应用SELDI-TOF-MS技术可以筛选出食管鳞癌相关的血清蛋白标志,建立的决策树模型可能对食管鳞癌的诊断具有重要的临床价值.
食管鳞癌、肿瘤标志物、SELDI-TOF-MS、蛋白质组
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R735.1;R73-34(肿瘤学)
上海市自然科学基金04ZR14113;江苏省科技计划BS2004525
2007-11-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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