进行性肌阵挛共济失调近亲家系全外显子测序漏诊原因分析与对策

摘要：

目的:分析近亲家系全外显子测序(whole exome sequencing,WES)中漏诊5例进行性肌阵挛共济失调(progressive myoclonic ataxia,PMA)患者的原因,并探讨对策.方法:收集5例WES未发现致病突变而临床拟诊为PMA患者,对其近亲婚配家系(三代以内旁系血亲婚配)进行全基因组SNP芯片扫描,通过纯合子定位技术及单倍型分析定位致病区间,结合患者的肌阵挛和共济失调表型,明确其可能的致病基因.采用Sanger测序对候选的突变位点进行家系共分离分析,最后通过溯源WES比对过程中的SAM与BAM文件,分析WES漏诊的原因.结果:纯合区间定位和重分析WES发现,5例PMA家系为NEU1基因c.544A>G(p.S182G)纯合突变导致的Ⅰ型唾液酸沉积症(sialidosis typeⅠ,ST-Ⅰ).人类基因组参考序列中的ALT contig在WES比对过程中可造成包括NEU1基因在内的多个PMA致病基因检出遗漏.结论:临床诊断中,常染色体隐性遗传的PMA需关注NEU1基因突变所导致的ST-Ⅰ.对于WES未发现致病位点的PMA家系,可结合家系遗传方式、全基因组SNP芯片等方法定位致病区间,再结合患者的临床表型以明确其疾病致病基因.

关键词：进行性肌阵挛共济失调、Ⅰ型唾液酸沉积症、全外显子测序、NEU1基因

所属期刊栏目：21

分类号：R541.7(心脏、血管（循环系）疾病)

在线出版日期：2022-11-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：456-461