基于癌症基因图谱挖掘前列腺癌不同Gleason分级癌组织相关基因分析

摘要：

目的:运用生物信息学探究不同Gleason分级(Gleason Pattern,GP)前列腺癌组织间的分子表达差异及其基因间的相互影响.方法:下载癌症基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)前列腺癌患者的转录组数据及GP资料,运用生物信息学分析GP 4级与GP 3级前列腺癌组织间的基因表达差异,进而通过基因本体(gene ontology,GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集及蛋白相互作用网络(protein protein interaction network,PPI),探究不同GP的前列腺癌组织间差异表达基因的相互作用及影响的生物学过程.结果:生信分析共鉴定出312个差异表达基因,且相较于GP 3级癌组织,GP 4级前列腺癌组织中存在157个基因表达上调,155个基因表达下调.生信分析显示,在基因相互作用网络中富集到的22个显著相关基因主要参与的生物学过程为细胞周期及有丝分裂.结论:GP 4级前列腺癌组织内的肿瘤细胞有丝分裂更为活跃,临床可通过检测细胞周期相关蛋白,协助对前列腺癌患者作出更合理的疾病风险及预后评估;同时,针对Gleason积分(Gleason score,GS)≥7分的患者,细胞周期相关蛋白有望成为其有效的治疗靶点.

关键词：前列腺癌、Gleason评分、癌症基因图谱、生物信息学、细胞周期

所属期刊栏目：17

分类号：R737.25(肿瘤学)

资助基金：上海市卫生计生委委级科研项目201540280

在线出版日期：2019-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：694-700