基于SSR-HRM技术的4种药用天麻变型遗传多样性及遗传结构分析

摘要：

目的 比较乌天麻 Gastrodia elata f.glauca、绿天麻 G.elata f.viridis、红天麻 G elata f.elata 和黄天麻 G elata f.flavida 4种药用天麻变型的遗传多样性、遗传结构和遗传信息差异,为天麻新品种选育提供依据.方法 从不同产地收集了 40份不同天麻变型的花茎.应用简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记与高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)相结合技术,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,从80对引物中筛选出15对多态性高的SSR引物.对这些天麻花茎样品进行实时荧光定量PCR扩增,统计遗传多样性参数,分析群体遗传结构,结合40份天麻的HRM数据进行聚类分析.结果 从15对SSR引物检测到114个等位基因,平均每对引物7.6个.天麻样品的观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)、期望杂合度(expected heterozygosity,He)、和 Nei's 多样性指数(Nei's diversity index,Nei)的平均值分别为 0.981 3、0.801 9 和 0.812 1,表明天麻的遗传多样性丰富.这4种天麻变型的遗传多样性不同,从高到低依次为乌天麻、绿天麻、红天麻和黄天麻.SSR-HRM分析将这40份天麻样品分为4个基因型,各天麻变型的大多数样品分布在不同的基因型中.这4种天麻变型之间的遗传距离不同,乌天麻与绿天麻遗传距离最近,与黄天麻遗传距离最远.结论 SSR-HRM技术对天麻基因分型更准确.这4种天麻变型的遗传信息不同,但存在基因交流现象.乌天麻与绿天麻亲缘关系最近,与红天麻次之,与黄天麻亲缘关系最远.可利用不同天麻变型遗传信息差异进行新品种选育.

关键词：天麻、乌天麻、绿天麻、红天麻、黄天麻、变型、SSR、HRM、遗传多样性、遗传结构、亲缘关系

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分类号：R286.12(中药学)

资助基金：国家自然科学基金;四川省科技计划项目

在线出版日期：2023-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2898-2906