ITS2条形码序列对海南大戟科植物的鉴定

摘要：

目的 利用DNA条形码技术评估ITS2序列对海南大戟科植物的鉴定能力.方法 利用PCR测序法,对供试样本ITS2片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,构建邻接(NJ)树.利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析.从ITS2数据库中获得供试样本的预测ITS2二级结构.结果 大戟科供试样本ITS2序列中变异位点与信息位点分别占总序列长度的84％和69.67％.供试各种在构建的NJ树中均各自成束,表现出单系性;基于ITS2序列的种内最大变异距离值0.067 3;种间最小变异距离值0.119 1,各ITS2二级结构种内无明显差异;种间存在明显差异.结论 所得ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,可作为DNA条形码序列对海南大戟科植物进行快速鉴定.

关键词：大戟科、ITS2、DNA条形码、鉴定、PCR测序

所属期刊栏目：47

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：海南省2013自然科学基金项目813190

在线出版日期：2016-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1572-1577