不同居群草珊瑚的ITS序列分析及模式识别研究

摘要：

目的 通过分析不同居群草珊瑚Sarcandra glabra和金粟兰属5种近缘植物的核糖体基因内部转录间隔区(rDNA-ITS)序列,为草珊瑚鉴定和品种鉴别提供模式识别与思路.方法 采集不同产地的草珊瑚18份、金粟兰6份,所有样品提取总DNA,并对其ITS片段进行扩增、测序,并搜索GenBank数据库中收录的其他4种金粟兰属植物的ITS序列,运用ClustalX 2.1软件比较不同产地草珊瑚与其他金粟兰属植物的ITS序列差异,并对其进行聚类分析.结果 草珊瑚样品不同居群间的ITS序列相似度达99％,其中位点总突变率ITS1(2.7％)＞ITS2(1.4％),而与金粟兰属其他植物相比,位点总突变率ITS2 (20.3％～22.7％) ＞ITS1 (15.9％～18.3％).聚类分析表明18个不同种群的草珊瑚居群间变异极小,且与金粟兰属5种近缘植物具有显著差异的聚类识别.结论 草珊瑚ITS1与ITS2分别为不同居群间及与不同属近缘植物间比较有效的鉴别序列,具有较多个特异性信息位点的草珊瑚ITS序列用于鉴别金粟兰属5种近缘植物,具显著差异的聚类识别,是草珊瑚和金粟兰属近缘植物鉴定和品种鉴别的有效分子标记.

关键词：草珊瑚、金粟兰、ITS序列、品种鉴别、聚类分析

所属期刊栏目：45

分类号：R282.12(中药学)

资助基金：福建省教育厅A类项目JA11138:福建省科技重大项目2011Y4005

在线出版日期：2015-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2982-2986