北柴胡皂苷生物合成途径关键酶IPPI的全长cDNA克隆及其序列分析

摘要：

目的 克隆北柴胡皂苷生物合成途径关键酶异戊烯基焦磷酸异构酶(EC 5.3.12,isopentenyl diphosphateisomerase,IPPD的全长cDNA,为研究柴胡皂昔的生物合成与基因调控奠定基础.方法 PCR矩阵法快速筛选北柴胡全长cDNA文库.结果 获得了北柴胡IPPI的全长eDNA(GenBank No.gy433719),其核苷酸序列长1 117by,编码319个氨基酸的蛋白.NCBI Blastx结果显示与胡萝卜Daucus carota subsp.sativus (abb52064)的IPPI氨基酸序列相似性最高,一致性为9200,相似度为97%.保守结构域搜索显示含有IPPI共有的催化活性位点、金属结合位点及Nudix基序.TargetPl.1和SignaIP3.0分析表明北柴胡IPPI N端含有长26 by的叶绿体信号肽.结论 首次克隆了北柴胡IPPI的全长cDNA,将促进后续北柴胡IPPI基因表达特性及其在柴胡皂苷合成代谢中功能的研究.

关键词：北柴胡、柴胡皂苷、异戊烯基焦磷酸异构酶(IPPI)、cDNA文库、PCR矩阵法

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分类号：R284.2(中药学)

资助基金：国家科技支撑计划重点项目2006BAI09B01;中央级院所长科研基金YZ-1-10

在线出版日期：2011-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1178-1184