龙眼GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析

摘要：

基于第三代龙眼基因组数据库及其转录组数据库,通过生物信息学分析对龙眼GDSL酯酶/脂肪酶家族进行全基因组鉴定.结果显示龙眼GDSL(DlGDSL)家族共有118个成员,分为15个亚家族,亚细胞定位显示主要分布于细胞外基质中.染色体位置及共线性基因分析表明,118个DlGDSL基因中有111个定位在15条龙眼染色体上,包括13对共线性基因.基因结构和蛋白质保守基序分析表明该家族的外显子在2～12之间,且motif2和motif3是D1GDSL家族中尤为重要的保守基序.启动子顺式作用元件分析表明,启动子序列中包含众多光响应、激素应答、无氧诱导、胁迫响应和昼夜节律等响应元件,且大部分成员都含有茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)、生长素(IAA)和赤霉素(GA)等激素应答作用元件.FPKM值分析发现从胚性愈伤组织到球形胚阶段有26个差异表达的基因,提示DlGDSL家族部分成员可能在龙眼体胚形态建成中发挥重要作用.qRT-PCR分析表明,在外源ABA和MeJA处理下龙眼胚性愈伤组织中,DlGDSL家族部分成员可能与ABA、MeJA等激素信号转导相关.

关键词：龙眼、GDSL、全基因组、鉴定、表达分析

所属期刊栏目：49

分类号：S667.2(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金;福建省自然科学基金;福建省高原学科建设经费资助项目;福建农林大学创新基金;福建农林大学创新基金

在线出版日期：2022-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共16页

页码：597-612