菜豆花色全基因组关联分析

摘要：

以124份菜豆为试验材料,分别在2019年和2020年调查花色表型,利用全基因组关联分析(GWAS)的方法对调控花色的基因进行挖掘.结果 表明:2年间供试菜豆花色表型基本一致,仅有1份材料存在差异.对124份菜豆材料进行重测序共获得517.58 Gb的数据量(10×),通过与菜豆参考基因组比对,获得5130030个SNP,过滤后得到3701584个SNP.利用这些高质量的SNP基于压缩混合线性模型(compress mixed linear model,cMLM)将菜豆花色调控基因定位在6号染色体322.67 kb的区域内;在候选区域内共鉴定到8个基因,其中,Phvul.006G020200为参与花青素调控的MYB转录因子基因,且在不同花色材料中差异性表达,为调控菜豆花色的关键候选基因.

关键词：菜豆;全基因组关联分析;花色;表达

所属期刊栏目：49

分类号：S643.1

资助基金：中国农业科学院科技创新工程项目;国家重点研发计划;农业部重点实验室开放基金

在线出版日期：2022-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：332-340