大白菜LEA家族基因的鉴定及其部分成员在低温胁迫下的表达分析

摘要：

基于大白菜全基因组数据对LEA家族基因进行全基因组鉴定与生物信息学分析,研究其序列特征、基因结构、启动子顺式作用元件、染色体定位、进化关系以及在不同组织中和低温胁迫下的表达模式.从大白菜基因组中总共鉴定出65个LEA家族基因成员,根据系统发育与保守基序分析,其可分为8个组;内含子较少,且不均匀地分布在10条染色体上,另有3个成员位于Scaffold上.启动子顺式作用元件分析显示,有29个(44.6％)成员拥有低温响应元件,除此之外,光响应元件和激素响应元件占比较高.共线性分析显示,大白菜BrLEA与拟南芥AtLEA同源性较高,并在进化中较为保守.大白菜不同组织转录组数据表明,BrLEA基因在大白菜不同组织中的表达存在组织特异性.对筛选出的13个家族成员进行低温胁迫表达分析表明,受低温胁迫表达量都有所升高.

关键词：大白菜;LEA基因家族;低温胁迫;生物信息学

所属期刊栏目：49

分类号：S634.1(蔬菜园艺)

资助基金：现代农业产业技术体系CARS-23-A-06

在线出版日期：2022-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：304-318