枣树阶段转变相关microRNA家族的鉴定及其表达分析

摘要：

与其他果树相比,枣树具有童期短、成花快的特征.已有研究表明,多个microRNA(miRNA)家族参与植物阶段转变和开花时间调控等过程.研究枣树阶段转变相关的miRNA家族对果树童期调控具有重要意义.以枣实生后代植株不同发育阶段(节位)的当年生枝(枣吊)为材料,通过Small RNA测序,在童期、过渡期和成年期等3个时期鉴定出27个miRNA家族的58个已知miRNA和23个新miRNA,其中44个差异表达的miRNA包括32个己知miRNA和12个新miRNA;然后,从中筛选出不同时期显著差异表达的6个miRNA,即zjmiR156a-5p、zjmiR 156j、zjmiR172c、zjmiR172e-3p、zjmiRnovel-16和zjmiRnovel-71,通过TargetFinder软件预测出它们的15个关键靶基因,其主要参与成花、转录调控和生物合成等过程;利用实时荧光定量PCR分析验证了12个miRNA及15个关键靶基因确实在枣树阶段转变中差异表达,并存在正调控或负调控关系,其中2个新miRNA(zjmiRnovel-16和zjmiRnovel-71)可能分别通过光周期和糖代谢途径影响阶段转变.

关键词：枣;阶段转变;microRNA;靶基因;Small RNA测序

所属期刊栏目：49

分类号：S665.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;国家重点研发计划;河北省高校百名优秀创新人才支持计划

在线出版日期：2022-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共18页

页码：23-40