切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析

摘要：

以58份切花菊为试验材料,调查了脚芽期、现蕾期和盛花期叶片以及盛花期舌状花低温半致死温度(LT50),利用全基因组关联分析挖掘耐寒性相关优异等位变异和候选基因.结果 表明,切花菊品种不同时期叶片或盛花期舌状花耐寒性变异较大,变异系数均大于25％;通过主效可加互作可乘(AMMI)模型的双标图分析筛选出抗寒性强且稳定性较好的品种‘天使’.基于36 737个高质量SNP位点和混合线性模型的关联分析,共挖掘出24个与耐寒性显著关联的SNP位点(P＜0.001),其中有5个、11个和5个SNP位点分别与脚芽期、现蕾期、盛花期叶片耐寒性相关,3个SNP位点与盛花期舌状花耐寒性相关;5个SNP位点的表型效应值小于-4℃,为优异等位变异位点.通过显著性SNP位点所在的SLAF标签序列与菊花转录组数据库进行比对分析,筛选得到5个候选基因,其中CL2042.Contig4_All和Unigene40993_All可能与冷胁迫有一定关联.

关键词：菊花、耐寒性、全基因组关联分析、候选基因

所属期刊栏目：46

分类号：S682.1+1(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：国家自然科学基金项目31572152;江苏省重点研发计划项目BE2018426;江苏省优势学科建设工程项目

在线出版日期：2020-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：2201-2212